厦门医学院附属第二医院神经外科是我院重点专业科室，是首都医科大学宣武医院神经外科合作科室，宣武医院神经外科主任张鸿祺教授系我科专家工作室特聘专家。科室现有医师9名，正高级职称专家4名，副高级职称专家2名，博士1名，硕士5名；护士17名，拥有本科学历以上护士 16 名 ，拥有一批年富力强、具有相当专业化水平的神经外科医师及一大批训练有素、专业化水平较高的护理队伍。  我科现有开放床位50张，其中神经重症床位6张，2023年手术量500余台，在以医院MRI、螺旋CT、PETCT、西门子双屏板DSA、TCD、EEG/BEAM等设备为依托的前提下，我科现拥有先进莱卡手术显微镜系统、进口神经内镜手术系统、多套进口手术动力系统、术中神经电生理监测系统、颅内压监测系统等先进专科手术和监测设备。 目前我科诊疗范围涵盖：重型和特重型颅脑创伤救治；各部位脑肿瘤-脊髓肿瘤微创手术；各类脑血管疾病的显微手术、介入手术、血管搭桥手术、颈动脉剥脱手术治疗；神经系统功能疾病（癫痫、帕金森病、三叉神经痛、面肌痉挛）的微创手术治疗；神经系统先天性疾病（脑积水、颅颈交界区畸形）的手术治疗等。其中脑脊髓血管病显微手术、介入手术是我科优势专业，诊治水平达到国内先进。 在不断发展临床诊治水平的基础上，医院作为厦门医学院直接附属医院，科室也十分重视科研、教学工作。近年来，完成或在研、参研省部级、科局级科研课题6项，发表SCI论文十余篇，国内核心期刊论文30余篇，专利4项。主要包括脑血管病的基础与临床研究、颅脑肿瘤的基础研究、脑出血基础与临床研究，承担厦门医学院各专业本科理论教学及实习带教工作。